O pós-doutorado é um estágio de estudo e pesquisa feito por um portador com o título de doutor numa universidade ou instituto de pesquisa, visando ao aprimoramento das suas habilidades de pesquisador e acadêmica. O pós-doutorado é temporário e não é um vínculo empregatício com a instituição. Na UNIFESP, o pós-doutorando não pode ministrar disciplinas na graduação, mas é possível ministrar aulas pontuais, desde que esteja acompanhado do docente responsável pela disciplina. O pós-doutorando também pode participar como avaliador de bancas de defesa de trabalhos de conclusão de curso (TCC), de dissertação de mestrado e tese de doutorado.

     O estágio de pós-doutorado pode ser realizado de forma voluntária ou com bolsas de agência de fomento à pesquisa, ou ainda com bolsa proveniente de recursos de projetos de pesquisa em parceria com a indústria.

     No PPGECM, para efeitos de certificação, o estágio de pós-doutorado tem duração mínima de 6 meses e máxima de 5 anos, de acordo com as normas da Pós-Graduação da UNIFESP.

     O Pós-doutorando deverá se recadastrar a cada ano com aval do supervisor, seguindo as instruções da Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa (ProPGPq). A não realização do recadastramento anual do pesquisador, sem justificativa pertinente e aceitável, poderá implicar no seu desligamento do estágio.